浙江紹興杭紹臨空示范區(qū)開發(fā)集團(tuán)有限公司（區(qū)軌道交通集團(tuán)）下設(shè)辦公室（黨建辦）、財(cái)務(wù)融資部、審計(jì)管理部、設(shè)計(jì)部（總師辦）、工程建設(shè)部、質(zhì)量安全部、征地拆遷部、招商管理部。浙江紹興杭紹臨空示范區(qū)開發(fā)集團(tuán)有限公司下設(shè)二級(jí)子公司10個(gè)，三級(jí)公司1個(gè)。區(qū)軌道交通下設(shè)二級(jí)子公司2個(gè)，三級(jí)子公司1個(gè)。